使用堆疊結合預測器#

堆疊是指混合估計器的方法。在這個策略中,一些估計器會個別擬合一些訓練資料,同時使用這些基礎估計器的堆疊預測來訓練最終的估計器。

在這個範例中,我們說明了將不同的迴歸器堆疊在一起,並使用最終的線性懲罰迴歸器來輸出預測的用例。我們會將每個個別迴歸器的效能與堆疊策略進行比較。堆疊會稍微改善整體效能。

# Authors: The scikit-learn developers
# SPDX-License-Identifier: BSD-3-Clause

下載資料集#

我們將使用 Ames Housing 資料集,該資料集最初由 Dean De Cock 編譯,並在用於 Kaggle 挑戰賽後變得更加知名。這是位於愛荷華州艾姆斯市的 1460 個住宅房屋的集合,每個房屋都有 80 個特徵描述。我們將使用它來預測房屋的最終對數價格。在這個範例中,我們將僅使用 GradientBoostingRegressor() 選擇的 20 個最有趣的特徵,並限制條目數量(這裡我們不會詳細介紹如何選擇最有趣的特徵)。

Ames 房屋資料集未隨 scikit-learn 提供,因此我們將從 OpenML 提取它。

import numpy as np

from sklearn.datasets import fetch_openml
from sklearn.utils import shuffle


def load_ames_housing():
    df = fetch_openml(name="house_prices", as_frame=True)
    X = df.data
    y = df.target

    features = [
        "YrSold",
        "HeatingQC",
        "Street",
        "YearRemodAdd",
        "Heating",
        "MasVnrType",
        "BsmtUnfSF",
        "Foundation",
        "MasVnrArea",
        "MSSubClass",
        "ExterQual",
        "Condition2",
        "GarageCars",
        "GarageType",
        "OverallQual",
        "TotalBsmtSF",
        "BsmtFinSF1",
        "HouseStyle",
        "MiscFeature",
        "MoSold",
    ]

    X = X.loc[:, features]
    X, y = shuffle(X, y, random_state=0)

    X = X.iloc[:600]
    y = y.iloc[:600]
    return X, np.log(y)


X, y = load_ames_housing()

建立管道以預處理資料#

在我們可以使用 Ames 資料集之前,仍然需要做一些預處理。首先,我們將選擇資料集的類別和數值欄位,以建構管道的第一步。

from sklearn.compose import make_column_selector

cat_selector = make_column_selector(dtype_include=object)
num_selector = make_column_selector(dtype_include=np.number)
cat_selector(X)
['HeatingQC', 'Street', 'Heating', 'MasVnrType', 'Foundation', 'ExterQual', 'Condition2', 'GarageType', 'HouseStyle', 'MiscFeature']
num_selector(X)
['YrSold', 'YearRemodAdd', 'BsmtUnfSF', 'MasVnrArea', 'MSSubClass', 'GarageCars', 'OverallQual', 'TotalBsmtSF', 'BsmtFinSF1', 'MoSold']

然後,我們需要設計預處理管道,這取決於最終迴歸器。如果最終迴歸器是線性模型,則需要對類別進行單熱編碼。如果最終迴歸器是基於樹狀的模型,則序數編碼器就足夠了。此外,數值需要針對線性模型進行標準化,而基於樹狀的模型可以按原樣處理原始數值資料。但是,這兩個模型都需要一個插補器來處理遺失的值。

我們將首先設計基於樹狀模型所需的管道。

from sklearn.compose import make_column_transformer
from sklearn.impute import SimpleImputer
from sklearn.pipeline import make_pipeline
from sklearn.preprocessing import OrdinalEncoder

cat_tree_processor = OrdinalEncoder(
    handle_unknown="use_encoded_value",
    unknown_value=-1,
    encoded_missing_value=-2,
)
num_tree_processor = SimpleImputer(strategy="mean", add_indicator=True)

tree_preprocessor = make_column_transformer(
    (num_tree_processor, num_selector), (cat_tree_processor, cat_selector)
)
tree_preprocessor
ColumnTransformer(transformers=[('simpleimputer',
                                 SimpleImputer(add_indicator=True),
                                 <sklearn.compose._column_transformer.make_column_selector object at 0x74b4aae32e20>),
                                ('ordinalencoder',
                                 OrdinalEncoder(encoded_missing_value=-2,
                                                handle_unknown='use_encoded_value',
                                                unknown_value=-1),
                                 <sklearn.compose._column_transformer.make_column_selector object at 0x74b4aae32850>)])
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然後,我們現在將定義最終迴歸器為線性模型時使用的預處理器。

from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder, StandardScaler

cat_linear_processor = OneHotEncoder(handle_unknown="ignore")
num_linear_processor = make_pipeline(
    StandardScaler(), SimpleImputer(strategy="mean", add_indicator=True)
)

linear_preprocessor = make_column_transformer(
    (num_linear_processor, num_selector), (cat_linear_processor, cat_selector)
)
linear_preprocessor
ColumnTransformer(transformers=[('pipeline',
                                 Pipeline(steps=[('standardscaler',
                                                  StandardScaler()),
                                                 ('simpleimputer',
                                                  SimpleImputer(add_indicator=True))]),
                                 <sklearn.compose._column_transformer.make_column_selector object at 0x74b4aae32e20>),
                                ('onehotencoder',
                                 OneHotEncoder(handle_unknown='ignore'),
                                 <sklearn.compose._column_transformer.make_column_selector object at 0x74b4aae32850>)])
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單一資料集上的預測器堆疊#

有時很難找到在給定資料集上效能最佳的模型。堆疊提供了一種替代方案,透過結合多個學習器的輸出,而無需特意選擇模型。堆疊的效能通常接近最佳模型,有時它可以勝過每個個別模型的預測效能。

在這裡,我們結合了 3 個學習器(線性和非線性),並使用嶺迴歸器將其輸出結合在一起。

注意

雖然我們會使用在前一節中為 3 個學習器編寫的處理器建立新的管道,但最終的估計器 RidgeCV() 不需要預處理資料,因為它將使用來自 3 個學習器的已預處理輸出饋送。

from sklearn.linear_model import LassoCV

lasso_pipeline = make_pipeline(linear_preprocessor, LassoCV())
lasso_pipeline
Pipeline(steps=[('columntransformer',
                 ColumnTransformer(transformers=[('pipeline',
                                                  Pipeline(steps=[('standardscaler',
                                                                   StandardScaler()),
                                                                  ('simpleimputer',
                                                                   SimpleImputer(add_indicator=True))]),
                                                  <sklearn.compose._column_transformer.make_column_selector object at 0x74b4aae32e20>),
                                                 ('onehotencoder',
                                                  OneHotEncoder(handle_unknown='ignore'),
                                                  <sklearn.compose._column_transformer.make_column_selector object at 0x74b4aae32850>)])),
                ('lassocv', LassoCV())])
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from sklearn.ensemble import RandomForestRegressor

rf_pipeline = make_pipeline(tree_preprocessor, RandomForestRegressor(random_state=42))
rf_pipeline
Pipeline(steps=[('columntransformer',
                 ColumnTransformer(transformers=[('simpleimputer',
                                                  SimpleImputer(add_indicator=True),
                                                  <sklearn.compose._column_transformer.make_column_selector object at 0x74b4aae32e20>),
                                                 ('ordinalencoder',
                                                  OrdinalEncoder(encoded_missing_value=-2,
                                                                 handle_unknown='use_encoded_value',
                                                                 unknown_value=-1),
                                                  <sklearn.compose._column_transformer.make_column_selector object at 0x74b4aae32850>)])),
                ('randomforestregressor',
                 RandomForestRegressor(random_state=42))])
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from sklearn.ensemble import HistGradientBoostingRegressor

gbdt_pipeline = make_pipeline(
    tree_preprocessor, HistGradientBoostingRegressor(random_state=0)
)
gbdt_pipeline
Pipeline(steps=[('columntransformer',
                 ColumnTransformer(transformers=[('simpleimputer',
                                                  SimpleImputer(add_indicator=True),
                                                  <sklearn.compose._column_transformer.make_column_selector object at 0x74b4aae32e20>),
                                                 ('ordinalencoder',
                                                  OrdinalEncoder(encoded_missing_value=-2,
                                                                 handle_unknown='use_encoded_value',
                                                                 unknown_value=-1),
                                                  <sklearn.compose._column_transformer.make_column_selector object at 0x74b4aae32850>)])),
                ('histgradientboostingregressor',
                 HistGradientBoostingRegressor(random_state=0))])
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from sklearn.ensemble import StackingRegressor
from sklearn.linear_model import RidgeCV

estimators = [
    ("Random Forest", rf_pipeline),
    ("Lasso", lasso_pipeline),
    ("Gradient Boosting", gbdt_pipeline),
]

stacking_regressor = StackingRegressor(estimators=estimators, final_estimator=RidgeCV())
stacking_regressor
StackingRegressor(estimators=[('Random Forest',
                               Pipeline(steps=[('columntransformer',
                                                ColumnTransformer(transformers=[('simpleimputer',
                                                                                 SimpleImputer(add_indicator=True),
                                                                                 <sklearn.compose._column_transformer.make_column_selector object at 0x74b4aae32e20>),
                                                                                ('ordinalencoder',
                                                                                 OrdinalEncoder(encoded_missing_value=-2,
                                                                                                handle_unknown='use_encoded_value',
                                                                                                unknown_v...
                                                                                 <sklearn.compose._column_transformer.make_column_selector object at 0x74b4aae32e20>),
                                                                                ('ordinalencoder',
                                                                                 OrdinalEncoder(encoded_missing_value=-2,
                                                                                                handle_unknown='use_encoded_value',
                                                                                                unknown_value=-1),
                                                                                 <sklearn.compose._column_transformer.make_column_selector object at 0x74b4aae32850>)])),
                                               ('histgradientboostingregressor',
                                                HistGradientBoostingRegressor(random_state=0))]))],
                  final_estimator=RidgeCV())
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衡量並繪製結果#

現在我們可以使用 Ames 房屋資料集進行預測。我們會檢查每個個別預測器以及迴歸器堆疊的效能。

import time

import matplotlib.pyplot as plt

from sklearn.metrics import PredictionErrorDisplay
from sklearn.model_selection import cross_val_predict, cross_validate

fig, axs = plt.subplots(2, 2, figsize=(9, 7))
axs = np.ravel(axs)

for ax, (name, est) in zip(
    axs, estimators + [("Stacking Regressor", stacking_regressor)]
):
    scorers = {"R2": "r2", "MAE": "neg_mean_absolute_error"}

    start_time = time.time()
    scores = cross_validate(
        est, X, y, scoring=list(scorers.values()), n_jobs=-1, verbose=0
    )
    elapsed_time = time.time() - start_time

    y_pred = cross_val_predict(est, X, y, n_jobs=-1, verbose=0)
    scores = {
        key: (
            f"{np.abs(np.mean(scores[f'test_{value}'])):.2f} +- "
            f"{np.std(scores[f'test_{value}']):.2f}"
        )
        for key, value in scorers.items()
    }

    display = PredictionErrorDisplay.from_predictions(
        y_true=y,
        y_pred=y_pred,
        kind="actual_vs_predicted",
        ax=ax,
        scatter_kwargs={"alpha": 0.2, "color": "tab:blue"},
        line_kwargs={"color": "tab:red"},
    )
    ax.set_title(f"{name}\nEvaluation in {elapsed_time:.2f} seconds")

    for name, score in scores.items():
        ax.plot([], [], " ", label=f"{name}: {score}")
    ax.legend(loc="upper left")

plt.suptitle("Single predictors versus stacked predictors")
plt.tight_layout()
plt.subplots_adjust(top=0.9)
plt.show()
Single predictors versus stacked predictors, Random Forest Evaluation in 1.20 seconds, Lasso Evaluation in 0.36 seconds, Gradient Boosting Evaluation in 0.45 seconds, Stacking Regressor Evaluation in 10.18 seconds

堆疊迴歸器會結合不同迴歸器的優點。但是,我們也看到訓練堆疊迴歸器的計算成本要高得多。

腳本的總執行時間: (0 分鐘 24.854 秒)

相關範例

繪製個別和投票迴歸預測

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梯度提升中的類別特徵支援

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顯示估算器和複雜的管線

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具有 AdaBoost 的決策樹迴歸

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